Σύμφωνα με το κατηγορητήριο, ο Μόρσι και 34 ακόμα υψηλόβαθμα στελέχη της Μουσουλμανικής Αδελφότητας, συνεργάστηκαν με τις ένοπλες οργανώσεις Χαμάς και Χεζμπολάχ, με στόχο τη διάπραξη τρομοκρατικών ενεργειών στην αιγυπτιακή επικράτεια.
Αν κριθούν ένοχοι αντιμετωπίζουν την εσχάτη των ποινών.
Η υπόθεση χαρακτηρίζεται ως «η μεγαλύτερη συνωμοσία στην ιστορία της Αιγύπτου». Οι Αδελφοί Μουσουλμάνοι κατηγορούνται μεταξύ άλλων για κατασκοπεία υπέρ ξένων δυνάμεων.
Μετά τις μαζικές λαϊκές διαδηλώσεις υπό την κάλυψη του στρατού τον Ιούλιο, ο Μόρσι καθαιρέθηκε και από τότε κρατείται.
Η δίκη του με την κατηγορία της υποκίνησης βιαιοτήτων και φόνων κατά τη διάρκεια της προεδρίας του, βρίσκεται σε εξέλιξη.
