Υπό τις περιστάσεις είπε ο κ. Κυπριανού, το φορτίο έπρεπε να κατασχεθεί και να φυλαχθεί στην Κύπρο το Φεβρουάριο του 2009, και είπε ότι λόγω πολιτικών δεδομένων δε συμφωνούσε στο να δοθεί το φορτίο πίσω στο Ιράν.
Εφόσον, είπε οι πολιτικοί λόγοι που οδήγησαν στην κατάσχεση του φορτίου δεν άλλαξαν, έπρεπε να συνεχιστεί η κατακράτησή του. Ο κ. Κυπριανού είπε ότι δε γνώριζε για πιθανούς κινδύνους που εγκυμονούσε η κατακράτηση του φορτίου, ενώ δεν είχε κάνει συγκεκριμένη εισήγηση για την τύχη του φορτίου, του οποίου τον τρόπο φύλαξης και συντήρησής του είχαν οι στρατιωτικοί και καμιά το Υπουργείο Εξωτερικών.
Με την απολογία του Μάρκου Κυπριανού, συνεχίστηκε η δίκη για τη φονική έκρηξη στο Μαρί. Ο πρώην Υπουργός Εξωτερικών επέρριψε την πλήρη ευθύνη στον τέως Πρόεδρο της Δημοκρατίας, Δημήτρη Χριστόφια, αλλά και στους στρατιωτικούς οι οποίοι είχαν την ευθύνη φύλαξης του φορτίου.
Πυρά κατά του τέως Προέδρου της Δημοκρατίας, Δημήτρη Χριστόφια, και της ηγεσίας της Εθνικής Φρουράς, εξαπέλυσε ο Μάρκος Κυπριανού σε γραπτή κατάθεση του που αναγνώσθηκε ενώπιον του Κακουργιοδικείου.
Ο πρώην Υπουργός Εξωτερικών, υποστήριξε ότι εάν ακολουθούσαν και άλλοι το παράδειγμά του και παραιτούνταν, δεν θα υπήρχε η πίεση της κοινής γνώμης και οι διωκτικές αρχές θα προχωρούσαν ανεπηρέαστα στην ποινική δίωξη εκείνων που πραγματικά ευθύνονται για την τραγωδία στο Μαρί.
Όπως υποστήριξε, το Υπουργείο Εξωτερικών δεν είχε καμία εμπλοκή στο θέμα επιλογής του χώρου και του τρόπου ασφαλούς φύλαξης του φορτίου, κάτι που, όπως είπε, ήταν δουλειά των στρατιωτικών.
Κατέθεσε, επίσης, ότι ο ίδιος και το Υπουργείο του, εφάρμοζαν σε διπλωματικό επίπεδο, την πολιτική που χάραξε ο Δημήτρης Χριστόφιας, ενώ δεν συμμετείχε σε καμία σύσκεψη που έλαβε απόφαση εκφόρτωσης των πυρομαχικών.
Μάλιστα, ο κύριος Κυπριανού, κατέθεσε στο δικαστήριο, πρακτικά της συνεδρία του Υπουργικού Συμβουλίου τις 11ης Φεβρουαρίου 2009, σύμφωνα με τα οποία ο τέως Πρόεδρος της Δημοκρατίας είχε εκφράσει την άποψη να κατακρατηθεί το φορτίο αφού αυτό δε θεωρείτο επικίνδυνο.
Ο κατηγορούμενος χαρακτήρισε επίσης «μεγάλο ψέμα» αυτό που ειπώθηκε σε προηγούμενες δικασίμους, από στρατιωτικούς, ότι επιχείρησε να αγοράσει χρόνο.
Ο Μάρκος Κυπριανού, εξέφρασε επίσης την πικρία του γιατί ο Γενικός Εισαγγελέας, κάτω από την πίεση του κόσμου, να διώξει κάποιον για τις πολιτικές αποφάσεις, επέλεξε, όπως είπε, τον ίδιο, ο οποίος εφάρμοζε την πολιτική του Προέδρου.
Κλείνοντας την κατάθεση του ο Μάρκος Κυπριανού ανέφερε ότι η παραίτηση του από τη θέση του Υπουργού Εξωτερικών για λόγους πολιτικής ευθιξίας, ήταν θέμα πολιτικής επιλογής και παιδείας και όχι αναγνώρισης πολιτικής ή ποινικής ευθύνης.
Στην απολογία του ο πρώην υπουργός Εξωτερικών υποστήριξε ότι δεν είχε καμία σχέση με το θέμα της φύλαξης του φορτίου. Δήλωσε ότι η κατάσχεση ήταν απόφαση του προέδρου της Δημοκρατίας και ο ίδιος είχε ρόλο να χειρίζεται την απόφαση ως υπουργός Εξωτερικών.
Ο κ. Κυπριανού επέρριψε ευθύνες για τη μη ασφαλή φύλαξη του φορτίου στην Εθνική Φρουρά και στο ΓΕΕΦ ενώ κατέθεσε και πρακτικό της σύσκεψης του Φεβρουαρίου του 2009 του Υπουργικού Συμβουλίου στο οποίο φαίνεται ο πρώην πρόεδρος της Δημοκρατίας Δημήτρης Χριστόφιας να αναφέρει ότι το συμφέρον του τόπου ήταν η κατάσχεση του φορτίου. Ο κ. Κυπριανού, είπε ακόμα ότι η παραίτησή του ήταν θέμα πολιτικής ευθιξίας και όχι ενοχών.
Ο Πρόεδρος του Κακουργιοδικείου Τεύκρος Οικονόμου ανακοίνωσε στην προηγούμενη δικάσιμο, στις 12 Φεβρουαρίου, την απόφαση των δικαστών ότι «στοιχειοθετείται εκ πρώτης όψεως υπόθεση», οι κατηγορούμενοι κλήθηκαν σε απολογία και σημείωσε ότι «μέχρι το τέλος της δίκης οι κατηγορούμενοι προστατεύονται από το τεκμήριο της αθωότητας».
