Στους 19 μήνες ως επικεφαλής του Πενταγώνου ο Πανέττα τερμάτισε την απαγόρευση που υπήρχε σε γυναίκες να υπηρετούν στην πρώτη γραμμής μάχης και πρωτοστάτησε ώστε ομοφυλόφιλοι και λεσβίες να υπηρετούν ανοικτά στον στρατό.
Ο Πανέττα όμως θα ενθυμείται περισσότερο ως ο επικεφαλής της CIA που επίβλεψε την επιδρομή που σκότωσε τον Οσάμα Μπιν Λάντεν.