Όταν η Κύπρος μπήκε στον κατάλογο των χωρών όπου εξαπλώθηκε η πανδημία, τον Μάρτιο, η Κυβέρνηση αποφάσισε, για σκοπούς προστασίας της δημόσιας υγείας, να κλείσει τα σύνορα, ακολουθώντας το παράδειγμα άλλων χωρών.
Από τις 21 Μαρτίου επιβλήθηκε καθολική απαγόρευση πτήσεων, γεγονός που εγκλώβισε χιλιάδες Κύπριους ταξιδιώτες και φοιτητές, σε διάφορες χώρες του κόσμου.
Το Υπουργείο Εξωτερικών ενεργοποίησε άμεσα το Κέντρο Διαχείρισης Κρίσεων, και σε συνεργασία με τα Υπουργεία Μεταφορών, Υγείας και Δικαιοσύνης, έθεσε σε εφαρμογή σχέδιο επαναπατρισμού.
Η πρώτη πτήση επαναπατρισμού προσγειώθηκε στο αεροδρόμιο της Λάρνακας στις 21 Μάρτιου στις 3 και 45 το πρωί, από το Λονδίνο, ενώ την ίδια ημέρα έφτασαν συνολικά τρεις πτήσεις από την πρωτεύουσα της Βρετανίας, μεταφέροντας συνολικά 432 άτομα.
Ο Υπουργός Μεταφορών, Γιάννης Καρούσος, είπε ότι «έχει ολοκληρωθεί ουσιαστικά πρώτη πτήση επαναπατρισμού Κυπρίων που βρίσκονταν στο εξωτερικό και είχαν εξασφαλίσει τις βεβαιώσεις και βρίσκονταν σε χώρες και δεν μπορούσαν να βρουν πτήση επιβατική για να επιστρέψουν πίσω στην Κύπρο».
Το πρόγραμμα επαναπατρισμού εντατικοποιήθηκε τις επόμενες εβδομάδες, με το Υπουργείο Εξωτερικών να θέτει σε λειτουργία και την πρωτοποριακή διαδικτυακή πλατφόρμα connect2cy, καλώντας τους Κύπριους που βρίσκονταν στο εξωτερικό να εγγραφούν, ώστε το κράτος να γνωρίζει που βρίσκονται.
Την ίδια ώρα, ο Υπουργός Εξωτερικών, επισήμανε «υπάρχει σχεδιασμός για όλους τους συμπατριώτες μας που βρίσκονται στο εξωτερικό και επιθυμούν να επαναπατριστούν».
Σε διάστημα πέραν των τριών μηνών πραγματοποιήθηκαν συνολικά 126 πτήσεις, εκ των οποίων οι 63 είχαν ως αφετηρία το Ηνωμένο Βασίλειο, μεταφέροντας συνολικά 11,233 επιβάτες. Η τελευταία πτήση επαναπατρισμού πραγματοποιήθηκε στις 19 Ιουνίου.
Προτεραιότητα δόθηκε στους Κύπριους πολίτες και στους μόνιμα διαμένοντες στην Κύπρο οι οποίοι είχαν ταξιδέψει τις προηγούμενες μέρες για επαγγελματικούς σκοπούς, για λόγους υγείας ή αναψυχής και είχαν αποκλειστεί στο εξωτερικό. Ακολούθησαν οι φοιτητές, και πρώτα όσοι ανήκουν στις ευπαθείς ομάδες, οι προσωρινά εργαζόμενοι στο εξωτερικό και τέλος άτομα για σκοπούς επανασύνδεσης οικογένειας.
Ο Γενικός Διευθυντής του Υπουργείου Εξωτερικών, Κορνήλιος Κορνηλίου, σημείωσε ότι «όπου δεν υπήρχε η δυνατότητα απευθείας πτώσεων, εκεί κάναμε μια έρευνα και εντοπίσαμε τα αεροδρόμια που ήταν ακόμα σε λειτουργία. Τους μαζεύαμε εκεί και τους μεταφέραμε στην Κύπρο, αυτό έγινε κυρίως μέσω Φρανκφούρτης, Άμστερνταμ, Λονδίνο και Κατάρ, Ντόχα».
Πολίτες επαναπατρίστηκαν συνολικά από περισσότερες από εκατό χώρες.
Απευθείας πτήσεις προς της Κύπρο έγιναν μεταξύ άλλων από Ελλάδα, Ηνωμένο Βασίλειο, Ιράν, Σαουδική Αραβία, Κουβέιτ, Κατάρ και Νότια Αφρική.
Πολίτες συγκεντρώθηκαν και επαναπατρίστηκαν από αεροδρόμια άλλων χωρών από 25 διαφορετικές χώρες. Ανάμεσά τους η Κίνα, το Περού, η Ουρουγουάη, το Μαρόκο, η Φιλιππίνες, η Ταϊλάνδη, η Γουατεμάλα και η Νέα Ζηλανδία.
Για τις ανάγκες κάλυψης της δεκατετραήμερης καραντίνας στην οποία έπρεπε να παραμείνουν όλοι όσοι επέστρεφαν στην Κύπρο, κατά το πρώτο κύμα της πανδημίας, διατέθηκαν χιλιάδες κλίνες σε ξενοδοχειακές μονάδες σε όλη την ελεύθερη Κύπρο.
