Οι μητροπολίτες Λεμεσού, Ταμασού, Κύκκου και ο Επίσκοπος Αμαθούντος, οι οποίοι αντιδρούν, δηλώνουν ότι ο Αρχιεπίσκοπος Χρυσόστομος με την συγκεκριμένη πράξη του κατήργησε την Ιερά Σύνοδο.
Μάλιστα ο Κύκκου Νικηφόρος, χαρακτήρισε την συγκεκριμένη απόφαση αυθαίρετη και αντικανονική.
Με παρέμβαση του στο «Μέρα Μεσημέρι» ο Μητροπολίτης Νικηφόρος τόνισε ότι « ο Μακαριότατος αυτός που έχει να κάνει είναι να ανακαλέσει την απόφαση αυτή. Η Ιερά Σύνοδος δεν είναι για να επικυρώνει αυθαιρεσίες του προκαθημένου. Η Ιερά Σύνοδος είναι να παίρνει αποφάσεις και να εφαρμόζει ο προκαθήμενος. δεν θα συρθούμε σε μια σύνοδο για να επικυρώσουμε μια αντικανονική πράξη».
Ο Μητροπολίτης Λεμεσού Αθανάσιος, ο οποίος το Σάββατο αποχώρησε από την ενθρόνιση του νέου επισκόπου Αρσινόης Παγκράτιου, στην ιερά Μονή Παναγίας Χρυσορροϊατίσσης, σε δήλωση στο Κυπριακό Πρακτορείο Ειδήσεων υπέδειξε ότι η απόφαση θα έπρεπε να ληφθεί από την Ιερά Σύνοδο.
Συγκεκριμένα ο Λεμεσού Αθανάσιος τόνισε πως « δεν μίλησα με τον Αρχιεπίσκοπο, έφυγα για να μην πούμε κάποια λόγια που δεν θα χρειαζόταν. Η Εκκλησία της Κύπρου εκφράζεται και διοικείται από την Ιερά Σύνοδο. Ο Αρχιεπίσκοπος είναι ο Προκαθήμενος της Εκκλησίας αλλά δεν μπορεί να αποφασίζει μόνος του, ούτε ο Αρχιεπίσκοπος χωρίς τη Σύνοδο, ούτε η Σύνοδος χωρίς τον Αρχιεπίσκοπο.
Πίσω από τη συγκεκριμένη απόφαση, σύμφωνα με άλλους Συνοδικούς, οι οποίοι ωστόσο δεν θέλησαν να τοποθετηθούν δημόσια, κρύβεται έντονο παρασκήνιο, το οποίο έχει να κάνει σχέση και με την διαμάχη του Οικουμενικού Πατριαρχείου με το Πατριαρχείο της Μόσχας.
Πάντως δεν αποκλείεται να προκύψουν και πολιτικές προεκτάσεις, με τη Λευκωσία ωστόσο να δηλώνει ότι δεν ανησυχεί για πιθανή διασάλευση των σχέσεων της με την Μόσχα, υποδεικνύοντας ότι η Ορθόδοξη Εκκλησία της Κύπρου είναι αυτοκέφαλη και εντελώς ανεξάρτητη από την κοσμική εξουσία.
Ο Πρέσβης της Ρωσίας στη Λευκωσία Στάνισλαβ Οσάτσι, σε παρέμβαση στην εκπομπή του ΑΝΤ1 «Μέρα Μεσημέρι», αρκέστηκε να χαρακτηρίσει ως ατυχή την συγκεκριμένη απόφαση.
Συγκεκριμένα ο Ρώσος Πρέσβης ανέφερε ότι «σημαίνει την ευχαριστιακή κοινωνία με ένα πρόσωπο και όχι με την εκκλησία της Κύπρου».
Η Εκκλησία της Κύπρου είναι η τρίτη Ορθόδοξη Εκκλησία, μετά την Εκκλησία της Ελλάδος και το Πατριαρχείο Αλεξανδρείας, που αναγνώρισαν τον Τόμο Αυτοκεφαλίας που χορήγησε το Οικουμενικό Πατριαρχείο στην Εκκλησία της Ουκρανίας. Πάντως η Παγκύπρια Ένωση Ελλήνων Θεολόγων και ο Σύνδεσμος Θεολόγων θεωρούν αχρείαστη την τοποθέτηση του Αρχιεπισκόπου Χρυσόστομου και υποστηρίζουν ότι αυτή δεν δεσμεύει την Εκκλησία της Κύπρου.