Στη φάση των ομίλων του Europa League θα συμμετάσχουν 48 ομάδες οι οποίες θα χωριστούν σε 12 ομίλους των τεσσάρων ομάδων.
Στην επόμενη φάση προκρίνονται οι δύο πρώτες ομάδες από κάθε όμιλο. Στις 24 ομάδες που προκρίνονται, προστίθενται και οι 8 ομάδες οι οποίες θα έρθουν από το Champions League. Πρόκειται για τις ομάδες οι οποίες θα πάρουν την 3η θέση στον όμιλο τους.
Σύμφωνα με τον αγωνιστικό σχεδιασμό της UEFA το ημερολογιακό πρόγραμμα της φάσης των ομίλων είναι καθορισμένο ως ακολούθως:
1η αγωνιστική: 20 Σεπτεμβρίου 2012
2η αγωνιστική: 4 Οκτωβρίου 2012
3η αγωνιστική: 25 Οκτωβρίου 2012
4η αγωνιστική: 8 Νοεμβρίου 2012
5η αγωνιστική: 22 Νοεμβρίου 2012
6η αγωνιστική: 6 Δεκεμβρίου 2012
Της κλήρωσης των ομίλων του Europa League, θα προηγηθεί η κλήρωση των ομίλων του Champions League, η οποία θα πραγματοποιθεί την Πέμπτη, 30 Αυγούστου, στις 18:45 Το τελετουργικό θα περιλαμβάνει και την ανάδειξη του κορυφαίου ποδοσφαιριστή της Ευρώπης για τη σεζόν 2011-12.
Το διήμερο των κληρώσεων και των εκδηλώσεων της UEFA στο Μονακό θα ολοκληρωθεί με τον αγώνα του Super Cup Ευρώπης μεταξύ της Τσέλσι και της Ατλέτικο Μαδρίτης που θα διεξαχθεί την Παρασκευή 31 Αυγούστου στις 21:45.
