Τις υποχρεώσεις με την στρατιωτική του θητεία φαίνεται να τακτοποίησε ο Γιάννης Γιαννιώτας έπειτα από τον πρόωρο αποχωρισμό από την Λιθουανία και την επιστροφή του στην γενέτηρά του.
Σύμφωνα με πληροφορίες όπως όλα δείχνουν το ζήτημα στρατιωτικής θητείας για το Έλληνα ποδοσφαιριστή θα λυθεί στην Κύπρο, υπηρετώντας την Ελληνική Δύναμη Κύπρου (ΕΛΔΥΚ) , έχοντας τις ζητούμενες διευκολύνσεις έτσι ώστε να είναι παρών στις υποχρεώσεις του στον Απόλλωνα.